Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn5O54942 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn5O54942 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms