Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms