Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms