Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaluO35887 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaluO35887 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaluO35887 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaluO35887 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaluO35887 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaluO35887 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaluO35887 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaluO35887 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaluO35887 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CaluO35887 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaluO35887 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaluO35887 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaluO35887 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaluO35887 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaluO35887 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaluO35887 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaluO35887 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaluO35887 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaluO35887 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaluO35887 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaluO35887 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaluO35887 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaluO35887 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaluO35887 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CaluO35887 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaluO35887 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaluO35887 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaluO35887 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaluO35887 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaluO35887 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaluO35887 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaluO35887 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CaluO35887 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaluO35887 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaluO35887 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaluO35887 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaluO35887 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaluO35887 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaluO35887 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaluO35887 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaluO35887 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaluO35887 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaluO35887 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaluO35887 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaluO35887 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaluO35887 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaluO35887 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CaluO35887 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaluO35887 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaluO35887 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaluO35887 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaluO35887 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaluO35887 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaluO35887 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaluO35887 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaluO35887 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaluO35887 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaluO35887 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaluO35887 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaluO35887 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaluO35887 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaluO35887 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaluO35887 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaluO35887 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaluO35887 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaluO35887 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaluO35887 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaluO35887 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaluO35887 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaluO35887 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaluO35887 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaluO35887 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaluO35887 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaluO35887 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaluO35887 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaluO35887 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaluO35887 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaluO35887 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaluO35887 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CaluO35887 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaluO35887 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaluO35887 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CaluO35887 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaluO35887 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaluO35887 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaluO35887 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaluO35887 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaluO35887 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaluO35887 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaluO35887 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaluO35887 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CaluO35887 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaluO35887 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaluO35887 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaluO35887 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaluO35887 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaluO35887 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaluO35887 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaluO35887 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms