Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pold2O35654 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pold2O35654 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pold2O35654 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms