Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Notch2O35516 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Notch2O35516 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Notch2O35516 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms