Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Foxd2O35392 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd2O35392 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms