Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ColqO35348 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ColqO35348 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ColqO35348 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ColqO35348 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ColqO35348 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ColqO35348 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ColqO35348 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ColqO35348 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ColqO35348 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ColqO35348 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ColqO35348 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ColqO35348 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ColqO35348 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ColqO35348 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ColqO35348 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ColqO35348 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ColqO35348 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ColqO35348 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ColqO35348 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ColqO35348 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ColqO35348 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ColqO35348 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ColqO35348 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ColqO35348 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ColqO35348 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ColqO35348 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms