Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2O35245 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms