Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Scarb2O35114 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb2O35114 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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