Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm3278L7N2D2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3278L7N2D2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms