Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm20939L7N243 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm20939L7N243 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm20939L7N243 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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