Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2056J3QQ02 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms