Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shisa8J3QNX5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa8J3QNX5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms