Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms