Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21863J3KMP8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21863J3KMP8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms