Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms