Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc4lG5E8X2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms