Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms