Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms