Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nccrp1G3X9C2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms