Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chrna9G3X8Z7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chrna9G3X8Z7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chrna9G3X8Z7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chrna9G3X8Z7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna9G3X8Z7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms