Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34aG3UW52 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms