Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
XntrpcF8VQM8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
XntrpcF8VQM8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XntrpcF8VQM8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XntrpcF8VQM8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XntrpcF8VQM8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XntrpcF8VQM8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XntrpcF8VQM8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XntrpcF8VQM8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XntrpcF8VQM8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XntrpcF8VQM8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XntrpcF8VQM8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XntrpcF8VQM8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XntrpcF8VQM8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms