Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5160F8VPN3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5160F8VPN3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms