Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm28038F7BCN9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm28038F7BCN9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm28038F7BCN9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm28038F7BCN9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm28038F7BCN9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28038F7BCN9 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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