Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4933403O08RikF6UK53 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms