Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngap1F6SEU4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms