Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm340F6RGI3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms