Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf165E9QAU8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rnf165E9QAU8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rnf165E9QAU8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rnf165E9QAU8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rnf165E9QAU8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rnf165E9QAU8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rnf165E9QAU8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rnf165E9QAU8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rnf165E9QAU8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rnf165E9QAU8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf165E9QAU8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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