Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4E9QAP7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms