Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930451I11RikE9Q9R3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms