Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TrdnE9Q9K5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrdnE9Q9K5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms