Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Simc1E9Q6E9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Simc1E9Q6E9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Simc1E9Q6E9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Simc1E9Q6E9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Simc1E9Q6E9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Simc1E9Q6E9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Simc1E9Q6E9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Simc1E9Q6E9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Simc1E9Q6E9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Simc1E9Q6E9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Simc1E9Q6E9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Simc1E9Q6E9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Simc1E9Q6E9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms