Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BC005561E9Q5E2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BC005561E9Q5E2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BC005561E9Q5E2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BC005561E9Q5E2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms