Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip11E9Q512 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip11E9Q512 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip11E9Q512 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip11E9Q512 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip11E9Q512 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms