Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CenpfE9Q3P4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpfE9Q3P4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms