Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tarbp1E9Q368 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms