Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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