Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Atad2bE9Q166 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atad2bE9Q166 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atad2bE9Q166 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms