Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt78E9Q0F0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt78E9Q0F0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms