Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20425E9Q035 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20425E9Q035 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20425E9Q035 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20425E9Q035 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20425E9Q035 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20425E9Q035 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20425E9Q035 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20425E9Q035 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20425E9Q035 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms