Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn4E9PX29 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms