Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms