Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc17E9PVB5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms