Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FgaE9PV24 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms