Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde2E9PUP1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms