Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms