Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms