Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms